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国内新三板市场的扩容，因为主办券商等机构的垄断，私募机构参与新三板的主要方式是借助投资新三板企业、或者推动已投资企业挂牌新三板。那么私募股权参与新三板与主办券商的运行模式有什么不一样?新三板挂牌的私募股权模式是什么?
目前私募股权机构的主要运作模式：
挂牌前投资
流程：挂牌前投资项目——新三板挂牌——转板上市。
投资业务是私募股权机构业务的源头，因此挂牌的数量和质量都尤为重要。所以，尽管新三板扩容取消了对拟挂牌企业盈利等方面的要求，但是私募股权机构仍然会选择具有独特盈利模式或者具有创新型业务的中小企业进行投资。根据新三板挂牌企业2014年年报来看，新三板挂牌公司中质地较为优良的做市公司明显高于协议转让公司，数据显示，做市挂牌公司2014年营收增速为11%，高于新三板整体10%的水平和协议板块7%的水平;从净利润增速来看，做市挂牌公司2014年净利润增速为34%，高于新三板整体23%的水平和协议转让板块16%的水平。而做市股票的表现也是水涨船高，成为高价股集中营。
所以，私募股权机构为了能在企业挂牌新三板后能够有较高估值退出，挑选独特盈利模式的公司尤为重要。目前，市场中私募股权机构普遍做法是在某几个行业内进行分析和考察，在关注企业财务指标以外，对企业管理层的水平也在进行判断。总之，挑选一个优秀的项目，需要专门的投研部门进行必要的客观分析，多方论证，才能最终获得。
在投资之后PE机构要能真正帮助企业获得实实在在的管理改善和价值提升。其后的任务就是将企业推向新三板，在企业挂牌后，知名度及估值的上升更容易吸引市场资本投入，而此时部分PE机构已经可以选择退出。
目前多数投资机构仍在等待新三板转板制度的推行，以期望获得更高估值退出。根据市场数据显示，截止2015年6月30日，创业板整体市盈率为107倍，而新三板评价市盈率为47倍，两者之间仍有较大差距。所以，在转板制度尚未推出时，私募股权机构的收益会受到很大限制。
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